深度解析医学证据,DeepEvidence为你支撑决策 EB病毒感染了全球超过95%的成年人,但其相关的鼻咽癌却呈现出极为不均衡的地理分布,近一半的病例集中在中国南方的少数人群中。这种流行病学谜团背后的原因一直未被完全阐明。以往研究虽然发现EB病毒高危亚型和宿主HLA基因与鼻咽癌风险有关,但两者是独立作用还是协同致病,长期缺乏因果证据。 为了破解这一难题,研究者设计了一套两步法的基因组-基因组互作分析策略。第一步,在747例鼻咽癌患者和1251例对照组成的发现数据集中,以高危EB病毒亚型(由BALF2-CCT三个位点定义)作为环境因子,对宿主全基因组进行交互作用扫描。结果发现HLA区域是唯一达到全基因组显著性的位点,其中HLA-A*11:01等位基因与高危EB病毒的交互信号最强。该交互效应在一个独立的644例病例和880例对照的验证数据集中得到了重复。第二步,研究者对324例病例和410例对照的配对宿主-病毒样本进行了EB病毒全基因组测序,并专门扫描与HLA-A*11:01存在交互作用的病毒变异。通过广义线性混合模型控制病毒群体结构和亲缘关系,发现EBNA3B基因上的单核苷酸变异858
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