深度解析医学证据，DeepEvidence为你支撑决策 2023年2月，丹麦暴发了一起由污染双氯西林胶囊引发的产碳青霉烯酶霍氏肠杆菌ST79感染事件，约7.9万名患者服用了受污染药品。初期克隆暴发调查仅发现11例携带原始菌株的患者，该菌株同时携带位于IncX3质粒的blaNDM-5基因和位于IncL质粒的blaOXA-48基因，且在1例患者中观察到了种间质粒转移现象。然而，此前尚无研究完整描述从药品污染导致的克隆暴发，演变为质粒介导的碳青霉烯酶基因广泛传播的全过程。为此，丹麦研究团队开展了一项回顾性、观察性分子流行病学研究，系统解析了此次暴发的克隆传播与质粒介导传播特征。 研究纳入了2014年1月1日至2023年10月1日丹麦全国碳青霉烯酶产生肠杆菌科（CPE）监测系统中的1829株分离株，来自1468名患者。研究人员首先通过生物信息学方法识别出两个暴发质粒的独特片段，即覆盖pDcap_OXA-48质粒Tn2插入位点的10023bp片段和覆盖pDcap_NDM-5质粒缺失IS30元件位点的100bp片段，以此为模板对所有短读长测序数据进行筛选，