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小眼畸形相关转录因子(MITF)调节黑色素细胞的发育,是黑色素瘤的“谱系特异性存活”致癌基因。MITF对黑色素瘤的发生、进展和复发至关重要,并被认为是重要的治疗靶点;然而,由于缺乏用于药物设计的配体结合口袋,通过小分子直接抑制MITF被认为是不可能的。
2023年1月2日,中国科学院上海有机化学研究所王婧、房鹏飞、俞飚、Guo Min、复旦大学陈勇及美国哈佛医学院David E. Fisher共同通讯在Cell Research(IF=46)在线发表题为“A unique hyperdynamic dimer interface permits small molecule perturbation of the melanoma oncoprotein MITF for melanoma therapy”的研究论文,该研究揭示了一种独特的超动态二聚体界面允许小分子扰动黑色素瘤癌蛋白MITF用于黑色素瘤治疗。该研究发现MITF的结构是高度动态的,因为它的不规则的亮氨酸拉链与3-残基插入。动态MITF非常容易受到二聚体破坏突变的影响,作者观察到人类Waardenburg综合征2A型的MITF功能丧失突变经常位于二聚体界面上,并因此破坏了二聚体的形成能力。这些观察结果表明,有一个独特的机会可以用能够破坏MITF二聚体的小分子来抑制MITF。
通过对654,650个化合物的高通量筛选,该研究发现了化合物TT-012,它特异性地与动态MITF结合,并破坏后者的二聚体形成和 DNA结合能力。通过染色质免疫沉淀试验和RNA测序,该研究发现TT-012抑制了B16F10黑色素瘤细胞MITF的转录活性。此外,TT-012抑制高MITF黑色素瘤细胞生长,在动物模型中抑制肿瘤生长和转移,对肝脏和免疫细胞的毒性可耐受。总之,这项研究证明了黑色素瘤癌蛋白MITF中独特的超动态二聚体界面界面,并揭示了一种治疗抑制MITF活性的新方法。


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