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目的:肺纤维化,也称为间质性肺病(ILD),发生在超过一半的系统性硬化症(SSc)患者中,并且是SSc 相关死亡率三分之一的死亡原因,目前尚无有效的治疗方式。该研究分析了系统性硬化症相关间质性肺病 (SSc-ILD) 的转录组数据,以评估与相关肺部疾病相关的显著分子和细胞特征,并确定疾病模块中的关键驱动基因和靶分子。
方法:来自 SSc-ILD (n=52)、特发性肺纤维化 (IPF) (n=549)、非特异性间质性肺炎 (n=49) 和肺动脉高压 (n=81) 和来自正常健康对照(n = 331)的差异表达基因被过滤、进行功能富集分析、基于网络的关键驱动分析和基于内核的扩散评分。在 SSc-ILD 患者中评估了富集的通路与临床参数之间的关联性。
结果:SSc-ILD 与其他纤维化肺部疾病具有共同的关键致病途径,但在某些病理过程中是可区分的。 SSc-ILD 在分子和细胞特征上与 IPF大致相似,但肌成纤维细胞的信号更强,在 SSc-ILD中肌成纤维细胞处于衰老和抗凋亡状态。 p53信号通路是SSc-ILD肺组织和肺成纤维细胞中最丰富的信号通路,与肺一氧化碳扩散能力、细胞衰老和凋亡显著相关。 EEF2、EFF2K、PHKG2、VCAM1、PRKACB、ITGA4、CDK1、CDK2、FN1 和 HDAC1 是疾病模块中具有高扩散评分的关键调节因子。
结论:肺组织的综合转录组分析揭示了 SSc-ILD 中纤维化的关键特征。基于网络的贝叶斯方法提供了对适用于治疗 SSc-ILD 的关键调控基因和分子靶点的深入见解。关键驱动基因在肺纤维化中起重要作用,能控制 SSc-ILD 的疾病模块,但它们都还不是当前治疗的直接靶点。
出处:
Jung SM, Park K, Kim K. Integrative analysis of lung molecular signatures reveals key drivers of systemic sclerosis-associated interstitial lung disease. Annals of the Rheumatic Diseases 2022;81:108-116.
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