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肝脏缺血再灌注损伤(IRI)是与肝脏移植相关的一种常见且不可避免的并发症,可能导致肝功能受损甚至移植后肝衰竭。尽管已有多种机制被认为与肝脏IRI的发病机制和进展有关,但在转录组和代谢水平上发生的特征性变化仍有待研究。
来自重庆医科大学的Yanyao Liu/Zhongjun Wu/ Huarong Yu教授团队在本刊发表了题为“Multi-time point transcriptomics and metabolomics reveal key transcription and metabolic features of hepatic ischemia-reperfusion injury in mice”的研究论文。该研究通过多时间点的转录组学和代谢组学分析,揭示了小鼠肝脏IRI损伤早期、中期和晚期的特征性转录和代谢变化,为IRI的机制研究和潜在治疗靶点提供了新的视角。
1、肝脏IRI模型的建立与验证
研究团队通过小鼠模型模拟肝脏IRI损伤,分别在1小时缺血后进行12小时、24小时和48小时的再灌注,分别对应IRI的早期、中期和晚期阶段。通过苏木精-伊红染色和血清肝酶水平检测,证实了IRI模型的成功建立,并发现肝损伤程度随再灌注时间延长而显著增加(图1)。

图1 肝脏IRI模型的建立与验证(原文中Figure 1)
2、差异表达基因的鉴定
转录组分析显示,在IRI早期(I1R12)、中期(I1R24)以及晚期(I1R48)与对照组(Sham)之间共鉴定出1115个差异表达基因(DEGs)。KEGG和GO分析表明,IRI早期以葡萄糖和碳水化合物代谢途径的富集为特征;中期以葡萄糖/脂质代谢途径的富集和炎症途径的激活为特征性变化;晚期则以脂质代谢途径的富集为主(图2)。

图2 KEGG和GO分析DEGs(原文中Figure 4)
3、差异表达代谢物的鉴定
代谢组学分析发现,IRI早期、中期和晚期的小鼠肝脏中脂质代谢的主要代谢特征发生了显著变化。定量分析显示,IRI早期(IR12)和中期(IR24)小鼠肝脏组织中游离脂肪酸水平显著降低,表明脂质代谢紊乱(图3)。

图3 肝脏IRI损伤涉及代谢重编程(原文中Figure 7)
总之,本研究通过转录组学和代谢组学分析,揭示了肝脏IRI损伤早期、中期和晚期的特征性转录和代谢变化。研究结果表明,葡萄糖和脂质代谢重编程在IRI的发生和发展中起关键作用,可能成为潜在的治疗干预靶点。研究还发现,IRI中期的炎症紊乱和PI3K-AKT通路的激活是调节IRI进程的重要机制。这些发现为深入理解IRI的病理机制提供了新的视角,并为开发新的治疗策略提供了理论依据。
文章来源
免费全文下载链接:
https://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S2352304224002629
引用这篇文章:
Li Q, Qin X, Wang L, et al. Multi-time point transcriptomics and metabolomics reveal key transcription and metabolic features of hepatic ischemia-reperfusion injury in mice. Genes Dis. 2025;12(2):101465.
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