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2025年1月13日,全球基因测序和芯片技术的领导者因美纳(纳斯达克股票代码:ILMN)宣布与deCODE Genetics、Standard BioTools、Tecan、葛兰素史克、强生和诺华公司合作,启动一项试点蛋白质组学项目,分析来自英国生物样本库(UK Biobank, UKB)的5万份样本。该试点项目基于因美纳即将推出的蛋白质组学检测方案Illumina Protein Prep™,由SOMAmer®技术提供支持,以新一代测序(NGS)解决方案助力科研界和制药合作伙伴规模化获取蛋白质组学洞见。
蛋白质组学为直接观测细胞功能提供了可能,从而帮助科研工作者深化对蛋白质在健康与疾病中作用的理解,并有助于发现癌症和心血管疾病等疾病的生物标志物。研究人员使用蛋白质数量性状位点(pQTLs),这是一种将遗传变异与蛋白质表达数据和疾病或其他表型相联系,用于药物发现的重要蛋白质基因组学工具。随着Illumina Protein Prep等高通量蛋白质组学方法的出现,新的pQTL的发现变得更加便捷。
“英国生物样本库的数据已经成为组学领域的标准参考数据集,在Illumina Protein Prep推出之际,我们很高兴能在这一试点研究中与医疗行业合作伙伴开展合作,” 因美纳首席技术官Steve Barnard博士表示,“我们相信该试点项目将为科研界和制药合作伙伴提供一套新的高质量、基于NGS的蛋白质组学数据,以促进生物学洞见的生成。”
英国生物样本库将提供5万份样本,这些样本均来自已参与英国生物样本库制药蛋白组学项目(UK Biobank Pharma Proteomics Project, UKB-PPP)的研究对象,该项目是英国生物样本库与14家生物制药公司之间的一项独立研究合作。deCODE Genetics将利用Illumina Protein Prep解决方案和NovaSeq™ X Plus测序仪对样本进行处理,并通过DRAGEN蛋白定量分析流程进行分析。首批3万份样本的研究由因美纳、deCODE Genetics和Standard BioTools, Inc.联合投资资助,Tecan作为自动化合作伙伴提供相应的支持。这些样本产生的数据将在2025年下半年完成质量控制后由英国生物样本库立即提供给科研界。
对于另外的2万份样本产生的数据,根据英国生物样本库的标准惯例,行业联盟成员将拥有一段时间的独家访问权。行业参与者包括deCODE Genetics及制药合作伙伴葛兰素史克、强生和诺华。在此专属期结束后,英国生物样本库将向更广泛的科研界提供这些数据。因美纳预计将有更多公司加入该联盟。
英国生物样本库首席研究员兼首席执行官Rory Collins爵士、教授表示:“这些日益丰富的蛋白质组学数据将帮助研究人员描绘出一幅更加动态的图景,呈现个体遗传、环境和生活方式如何共同影响不同疾病的发展。”
“这一项目补充了英国生物样本库制药蛋白组学项目的工作,在原先项目基础上提供了额外的蛋白质组学检测数据。我很期待看到全球科学界如何利用这些不同来源的数据,在预防和治疗多种疾病的新方法开发中取得突破性进展。”
“蛋白质组学正在进入一个变革的时代,迄今为止,其在人类健康领域的影响受到传统技术的限制,” Standard BioTools, Inc.首席执行官Michael Egholm博士表示,“今天标志着一个重要的里程碑,因为我们将顶尖的,具备多种能力的由DNA驱动的SOMAmer技术与领先的NGS平台无缝集成,进一步释放英国生物样本库的潜力以加速人类健康的发展。”
检测方法通过11K SOMAmer(慢解离速率修饰适配体)试剂检测9,000种独特的人类蛋白质,实现从样本到分析的蛋白质组学发现研究。这一解决方案已在早期试用中为客户所用,能够检测6,000种人类蛋白质,并与NovaSeq X、NovaSeq X Plus以及NovaSeq 6000测序仪兼容,从而在单一平台上实现多组学研究。该解决方案计划于2025年上半年正式推出。
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