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感染是癌症发生发展及治疗过程中常见的并发症之一。据统计,我国有40%-50%的实体瘤患者死亡原因是感染,肺癌患者感染的几率较大,有研究表明68.18%的肺癌患者直接或间接死于肺部感染,伴肺部感染的晚期肺癌患者死亡率为27.96%。超60%的肿瘤患者病情恶化也是因为感染。
自2014年牛津纳米孔科技有限公司(Oxford Nanopore Technologies, ONT)发布第一台纳米孔测序仪MinION以来,纳米孔测序技术及其应用研究飞速增长。该技术利用纳米级蛋白质孔(纳米孔)作为生物传感器,嵌入电阻性聚合物膜中,在电解液中施加恒定电压,以产生通过纳米孔的离子电流,DNA链在马达蛋白(phi29 DNA聚合酶)的牵引下穿过纳米孔,易位期间离子电流的变化对应于传感区域中的核苷酸序列,之后使用算法进行解码,实现对单分子的实时测序。
与传统的检测方法相比,纳米孔靶向测序阳性率大于 50%,耗时 1 天,测序通量高达 1 万至 2 万种微生物。检测范围覆盖全部的细菌、真菌、非典型病原菌、结核分支杆菌、非结核分枝杆菌、DNA 病毒和 RNA 病毒,能够真正地做到与时间和生命赛跑,兼具仪器便捷性和实时检测分析两大特点。
近年来在个体化医疗和精准医疗的大背景下,随着临床需求的不断增长,经过前期性能验证和数据积累,分子诊断正式进入四代纳米孔测序时代,纳米孔测序仪具有超长读长、实时测序等优势,对微生物鉴定具有分辨率高、时效性快等特点,真正实现快速、准确、全面,契合临床研究的抗感染需求,可做到极致16小时交付。用于肿瘤样本因白细胞计数偏低、抵抗力过低等造成严重感染而入院,早期精准诊断有利于抗感染治疗。
2022年11月12日,第25届全国临床肿瘤学大会暨2022年CSCO学术年会特别邀请到云南省肿瘤医院主任医师周永春博士,为我们介绍纳米孔测序在肿瘤患者感染中的应用。
参考资料:
https://mp.weixin.qq.com/s/7JGyusbv7s7Lu-8hGLxqvA
https://mp.weixin.qq.com/s/SLCtnhTBoZspIxZSWH6vIQ
https://mp.weixin.qq.com/s/ZW4NDn668k2YmsaEDO3sXQ
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