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急性髓系白血病(acute myeloid leukemia, AML)是一种异质性疾病,其特征是髓系祖细胞恶性增生。替代性聚腺苷酸化(alternative polyadenylation, APA)是一种转录后调控机制,可影响mRNA的稳定性和翻译效率,从而参与多种生物学过程,包括肿瘤的发生发展。近年来,研究发现 APA 异常调控与 AML 进展相关,但具体机制尚不清楚。
西安交通大学的Xiaoming Wu教授团队在本刊发表了题为“Lengthening of the CHURC1 3’ untranslated region by alternative polyadenylation is associated with the progression of acute myeloid leukemia”的研究快讯,通过分析AML患者的RNA测序数据,揭示了CHURC1基因3'UTR延长与AML进展之间的关联,并提出了CHURC1 APA位点使用可能作为AML生物标志物的新观点。
1 研究方法
研究团队收集了来自AML患者的3个独立RNA测序数据集,并比较了AML细胞与健康造血干祖细胞的APA特征。他们重点研究了CHURC1基因,并分析了其APA位点使用情况与AML进展和预后之间的关系。
2 研究结果
研究团队在AML样本中发现CHURC1基因3'UTR延长与表达上调相关(图1B)。在TCGA AML数据集中,CHURC1的低PDUI(远端聚腺苷酸化位点使用指数)是患者预后的风险因素(图1D)。rs6745单核苷酸多态性通过产生新的聚腺苷酸化信号,导致CHURC1远端聚腺苷酸化位点使用增加(图1E、F)。RNA结合蛋白TIA1在AML中表达下调,其与CHURC1的PDUI呈正相关,表明TIA1可能通过与CHURC1的替代3'UTR结合,促进远端聚腺苷酸化位点的使用(图1G)。
此外,研究团队发现CHURC1的3'UTR延长可能通过海绵吸附miR-186e5p,上调DICER1的表达,从而影响AML细胞的凋亡(图1H)。在CHURC1高表达组中,与细胞凋亡、p53信号通路、氧化磷酸化等相关的信号通路被显著抑制(图1I、J)。研究还发现,CHURC1 PDUI与8种化疗药物的IC50值呈负相关,提示高PDUI患者可能对这些药物更敏感(图1K)。
图1由APA引起的CHURC1 3'UTR变化与AML相关
3 研究结论
CHURC1的APA位点使用与AML进展和预后相关。CHURC1 3'UTR长度通过海绵化 miR-186e5p来增加DICER1的表达,进而影响AML进展相关通路活性。此外,CHURC1 的APA位点使用与多种化疗药物的敏感性相关,提示其可能作为 AML 治疗和预后评估的潜在生物标志物。
文章来源
免费全文下载链接:
https://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S235230422400045X
引用这篇文章:
Hu X, Cao P, Wang F, et al. Lengthening of the CHURC1 3' untranslated region by alternative polyadenylation is associated with the progression of acute myeloid leukemia. Genes Dis. 2025;12(1):101248.
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