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肺腺癌(LUAD)是一种高度异质性的疾病,不同患者之间的临床表现和治疗反应存在明显差异。为了推动精准医疗的发展,开发能够区分不同疾病表型并预测患者对治疗干预敏感性的临床工具显得尤为迫切。T淋巴细胞介导的细胞毒性是抵御肿瘤免疫反应的关键环节,也是癌症免疫疗法的基础。
河南省人民医院的Li Wei教授团队在本刊发表了题为“Implications of T cell-mediated tumor killing genes for molecular heterogeneity and clinical stratification in lung adenocarcinoma”的研究快讯,利用 T 细胞介导的肿瘤杀伤基因 (GSTKKs) 表达谱,对 LUAD 进行分子分型,并探究了不同亚型在临床预后、生物学特征、突变景观和免疫特征等方面的差异,为 LUAD 的精准治疗提供了新的思路。
1、研究方法
研究团队汇集了4个独立队列的1 735个样本,包括具有完整临床信息的TCGA-LUAD队列和3个GEO队列用于外部验证。通过分析GSTKKs在肿瘤和正常组织中的表达差异,及其与患者总生存期的相关性,筛选与预后显著相关的GSTKKs。基于这些GSTKKs的表达水平,研究团队通过共识聚类分析将 LUAD 患者分为GSTKK1、GSTKK2和GSTKK3三个亚型。
2、研究结果
通过Kaplan-Meier分析,研究团队发现3个亚型存在显著的生存差异,其中GSTKK2亚型的预后最差。基因集富集分析(GSEA)显示,GSTKK2亚型富含促进细胞周期进展途径,如活性氧和线粒体代谢,而GSTKK3亚型则显示出与免疫激活相关的途径的富集,如IL6-JAK-STAT信号传导、TNF-α信号传导和IFN-γ反应。此外,GSTKK2 亚型的体细胞突变频率、拷贝数变异和基因组不稳定性指标均高于其他亚型。
研究团队还分析了3种 GSTKKs 亚型在肿瘤免疫循环、T 细胞炎症特征、免疫相关特征和免疫分子表达、以及抗 PD-1 和抗 CTLA-4 治疗的敏感性等方面的差异。 GSTKK3 亚型表现出最高的免疫细胞浸润水平,包括 CD8+ T 细胞、自然杀伤细胞和树突状细胞,对抗 PD-1 和抗 CTLA-4 治疗表现出更高的敏感性,表明GSTKK3 亚型患者可能从免疫治疗中获益更多(图1)。
图1 基于 GSTKKs 的亚型的免疫循环特征。
3、研究结论
该研究利用预后GSTKKs来定义具有不同临床结果、生物学特征、突变景观、免疫特征和预测治疗反应的LUAD亚型。这为基于亚型特定靶点和免疫治疗敏感性的定制治疗提供了框架。这些发现展示了通过分子亚型指导的预测性生物标志物在精准肿瘤学中的作用,为肺腺癌的精准治疗提供了新的思路和方法,具有重要的临床意义和应用价值。
文章来源
免费全文下载链接:
https://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S2352304223004452
引用这篇文章:
Qiao T, Yin B, Liang J, Wei L. Implications of T cell-mediated tumor killing genes for molecular heterogeneity and clinical stratification in lung adenocarcinoma. Genes Dis. 2024;11(4):101162.
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