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一年一度的美国肝病研究学会年会(AASLD2023)于美国波士顿拉开帷幕。经过几十年的发展,AASLD已经成长为有关肝病各个方便研究的国际性组织。该协会的年会是目前世界上最大的、聚集肝脏病学家最多的会议,本次会议将汇集世界各地超过9500名肝病学家和从事肝病研究的专业人士参加,交流肝病学领域的突破性研究成果,以及新的治疗指南以及最新的治疗进展。
非酒精性脂肪性肝病(NAFLD)是世界范围内最常见的慢性肝病,包括非酒精性脂肪变性、非酒精性脂肪性肝炎、肝纤维化和肝硬化。越来越多的证据显示,NAFLD是肝细胞癌(HCC)的重要危险因素,而肝纤维化是HCC的一个关键阶段。目前,尽管临床检查对NAFLD及其各个阶段的诊断提供了有效的帮助,但并不能预测NAFLD合并肝纤维化进展为HCC的可能性。因此,有必要挖掘相关生物标志物来完善这一不足。
在此次年会上,研究人员发表了一项新研究,旨在筛选出预测NAFLD进展为HCC的分子标志物。研究人员通过下载了GEO数据库中NAFLD合并纤维化和NAFLD相关HCC的RNA-seq数据来鉴定差异表达基因。为了探索差异表达基因的潜在功能和风险预测的关键基因,并对两组差异表达基因的交集基因进行了GO和KEGG富集分析以及蛋白相互作用分析,同时鉴定出预测NAFLD发展为HCC风险的关键基因。随后,确定最适合预测NAFLD合并肝纤维化进展为HCC的基因模型。此外,为了评估基因模型的性能,研究人员利用两组肝脏组织测序数据进行了验证,第一组包含NAFLD合并肝纤维化和NAFLD相关HCC的测序数据,第二组包含NAFLD合并肝纤维化和NASH相关HCC的测序数据。利用ROC曲线评估基因模型性能。
结果显示,在NAFLD合并肝脏纤维化的数据集中鉴定出559个差异表达基因,在NAFLD相关 HCC的数据集中鉴定出2164个差异表达基因,共88个交叉基因。交叉基因与活性氧应答、应激激活的MAPK级联反应、凋亡信号通路和IL-17信号通路的正调控密切相关。蛋白相互作用网络将7个基因鉴定为关键基因,包括TIPM1、COL1A1、CXCL9、FOS、VWF、CD79A和VCAN,并利用7个关键基因构建基因模型。

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