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通过谷氨酸脱氢酶产生氨被SIRT4抑制,SIRT4是一种具有酰胺酶和非酰胺酶活性的sirtuin。氨基酸对氨去除的调节过程尚不清楚。
2023年4月20日,复旦大学赵世民、徐薇及赵健元共同通讯在Nature Metabolism在线发表题为“Amino acids downregulate SIRT4 to detoxify ammonia through the urea cycler”的研究论文,该研究揭示了SIRT4调控细胞氨脱毒机制。该研究报道SIRT4作为一种脱氨基酶,对氨基酸充足作出反应并调节氨的去除。氨基酸促进鸟胺酸氨甲酰基转移酶(OTC)的赖氨酸307氨甲酰化修饰(OTCCP-K307),激活OTC和尿素循环。
蛋白质组学和相互作用组筛选鉴定OTC是SIRT4的底物。氨基酸不足激活的GCN2-eIF2α-ATF4轴上调了SIRT4的表达。在培养细胞中敲除SIRT4导致OTCCP-K307水平升高,OTC被激活,尿素循环中间体和通过氨基酸分解代谢产生的尿素增加。Sirt4消融降低雄性小鼠血氨水平,改善CCl4诱导的肝性脑病表型。总之,该研究发现SIRT4在氨基酸分解代谢过程中保护细胞氨毒性。

除葡萄糖和脂肪酸外,细胞能量的三大来源之一—氨基酸的分解会产生有毒的氨。细胞通过将氨基酸的胺基转移到α-酮戊二酸形成谷氨酸,从而防止氨毒性,谷氨酸随后在线粒体的双膜封闭亚细胞区室中释放氨。线粒体氨甲酰磷酸合成酶1 (CPS1)将氨转化为氨甲酰磷酸(CP), CP通过OTC催化与鸟氨酸反应生成瓜氨酸。瓜氨酸然后引导氨进入尿素循环。氨的低效去除会导致高氨血症以及中枢神经元系统毒性,从而导致肝性脑病(HE)等疾病。已知的尿素循环调节过程表明,CPS1受代谢产物的调节和修饰,OTC和精氨酸琥珀酸裂解酶(ASL)的活性受乙酰化调节;然而,氨基酸充足和/或氨基酸分解代谢和氨去除之间的联系在很大程度上仍然不清楚。
高氨水平导致CP的产生增加,CP会自发地经历蛋白质赖氨酸氨甲酰化修饰(CP-K),这是一种翻译后修饰,也可以通过异氰酸酯或硫氰酸酯的分解代谢物与蛋白质中赖氨酸的ε-氨基的非酶结合发生。CP-K的一个广泛认可的作用是激活Rubisco,一种在植物和其他生物中固定碳的蛋白质。在人类中,CP-K在生理和病理学上很重要,因为在患有肾脏疾病,炎症的患者的血浆和组织中发现了高水平的氨基甲酰化蛋白或高龄;然而,尚未鉴定出去除CP-K的酶。由于在sirtuins中不断检测到新的酰胺酶活性,因此不能排除酰胺键CP-K受到动态调节的可能性。
SIRT4是线粒体中一种缺乏去乙酰化酶活性的sirtuin,具有谷氨酸脱氢酶(GDH)的ADP核糖基转移酶活性,丙酮酸脱氢酶复合物的脂酰胺酶活性,并且可以逆转由赖氨酸代谢产生的活性酰基辅酶A引起的赖氨酸修饰。在小鼠中,Sirt4缺失会导致胰岛素分泌失调,加速年龄诱导的胰岛素抵抗。SIRT4通过协调脂质分解代谢和合成之间的平衡来调节脂质稳态。此外,mTORC1通过抑制SIRT4的转录来刺激谷氨酰胺代谢。据报道,sirt4基因敲除的果蝇表现出寿命短、生育能力和活动能力下降。SIRT4的缺失也会导致小鼠的肿瘤形成。这些观察结果表明SIRT4在调节细胞代谢中起作用。

氨基酸调控的SIRT4协调氨解毒和尿素循环示意图(图源自Nature Metabolism )
该研究表明,SIRT4调节氨的产生和清除,是氨稳态的协调者。当氨基酸稀缺时,通过GCN4介导的机制诱导高SIRT2同时产生ADP-核糖磺酸并灭活GDH,GDH是线粒体中的主要氨发生者并消除OTCCP-K307灭活OTC和尿素循环。当氨基酸丰富且氨基酸分解代谢被激活时,诱导低SIRT4,从而激活GDH和氨的产生,而多余的氨则通过尿素循环被活化的OTC去除。这种机制确保了氨基酸的细胞氮供应,避免了氨的毒性。
本工作由复旦大学赵世民(复旦大学附属红房子妇产科医院)、徐薇(复旦大学生物医学研究院)、赵健元团队完成,清华大学李海涛团队提供了关键的技术帮助。复旦大学附属红房子妇产科医院/遗传工程国家重点实验室/代谢与整合生物学研究院/生物医学研究院博士生胡颂华(已毕业)、冯雨阳为论文共同第一作者。
原始出处:
Hu, SH., Feng, YY., Yang, YX. et al. Amino acids downregulate SIRT4 to detoxify ammonia through the urea cycle. Nat Metab (2023). https://doi.org/10.1038/s42255-023-00784-0.
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