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背景:归脾汤(GPD)源自宋朝严氏《济生方》,主要用于治疗心脾两虚,经后世医生的临床实践,其应用范围得到了拓展,不仅能改善胃肠(GI)功能,还能改善抑郁情绪。
该研究用党参代替人参,在原方的基础上加入玫瑰以益气解郁,并将所有药物联合使用,达到健脾宁心、养血安神的效果。这项生物信息学研究旨在揭示抑郁症和胃肠道疾病之间潜在的串扰基因和相关途径。采用网络药理学方法探讨GPD同时治疗抑郁共病胃肠道疾病的分子机制和潜在靶点。
方法:基于GSE98793和GSE19738基因对重度抑郁症(MDD)差异表达基因(DEGs)进行鉴定,并从GeneCards数据库中筛选GI疾病相关基因。获得MDD和GI疾病之间的重叠基因,以鉴定潜在的串扰基因。构建蛋白-蛋白相互作用(PPI)网络筛选枢纽基因,LASSO回归分析鉴定特征基因,单样本基因集富集分析(ssGSEA)分析免疫细胞浸润。
此外,基于中药系统药理学(TCMSP)数据库,筛选GPD的有效成分和靶点,分别确定GPD与MDD和GI疾病相关基因的交叉靶点。利用Cytoscape构建了一个“组件-目标”网络,并对基因本体(GO)和京都基因与基因组百科全书(KEGG)通路进行了分析。
结果:MDD校正后的数据集包含2619个DEG,共获得109个串扰基因。筛选14个枢纽基因,分别为SOX2、CRP、ACE、LEP、SHH、CDH2、CD34、TNF、EGF、BDNF、FN1、IL10、PPARG、KIT。这些基因通过LASSO回归分析鉴定了3个特征基因,包括TNF、EGF和IL10。Gamma.delta.T.cell与这三个特征基因均呈显著正相关,而Central.memory.CD4.T.细胞和Central.memory.CD8.T.细胞与EGF和TNF呈显著负相关。
GPD含有134种有效成分和248个靶点,其中治疗抑郁症和胃肠道疾病的相关靶点分别为41个和87个。EGF、PPARG、IL10和CRP与该疾病的中枢基因重叠。
结论:该研究发现GPD可能通过EGF、PPARG、IL10和CRP靶点调控炎症和氧化应激反应,进而参与抑郁症和GI疾病的治疗。
原始出处:
Liu M, Fan G, Liu H. Integrated bioinformatics and network pharmacology identifying the mechanisms and molecular targets of Guipi Decoction for treatment of comorbidity with depression and gastrointestinal disorders [published online ahead of print, 2023 Oct 17]. Metab Brain Dis. 2023;10.1007/s11011-023-01308-1. doi:10.1007/s11011-023-01308-1.
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