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研究目标:
炎症被认为是肺动脉高压(PAH)发展的一个因素,而化学因子及其受体通过协调免疫细胞的招募和功能来发挥作用。本研究旨在通过转录组分析来识别PAH进展中的关键化学因子。
研究方法:
通过基因表达组学数据库(GEO)比较PAH患者与对照组的肺部差异表达基因(DEGs)。应用基因集富集分析(GSEA)进行功能注释和通路富集。采用xCell算法估计免疫细胞的丰度。采用加权相关网络分析(WGCNA)构建基因表达网络,基于此生成一个诊断模型,以确定其在区分PAH和对照对象方面的准确性。然后,在缺氧诱导的肺动脉高压(PH)小鼠模型中验证目标基因。
研究结果:
在多个数据集中,PAH肺组织中的ACKR4(非典型化学因子受体4)表达下调。根据GSEA富集分析,与低ACKR4水平的患者相关的PAH相关生物功能和通路得到了富集。免疫浸润分析显示激活的树突状细胞、Th1细胞和巨噬细胞的浸润与ACKR4表达呈负相关。通过WGCNA分析,发现三个基因模块与PAH相关,并使用CXCL12、COL18A1和TSHZ2构建了一个PAH诊断模型,这些基因与ACKR4呈相关关系。在我们的实验PH小鼠的肺组织中,ACKR4表达也下调与对照组相比。
研究结论:
在本研究中,我们首先通过差异基因分析确定,在所有选定的数据集中,编码ACKR4的非典型化学因子受体4在PAH肺组织中表达下调。随后,根据GSEA富集分析,发现在ACKR4水平低的患者中,PAH相关的生物功能和通路得到了富集。同时,我们还发现多个免疫细胞浸润与ACKR4表达呈负相关。通过WGCNA分析筛选出与PAH相关的三个基因模块,并最终构建了一个诊断模型以区分PAH和对照对象。与此同时,我们的实验PH小鼠的肺组织中ACKR4的表达水平也与对照组相比呈下调状态。值得注意的是,ACKR4的表达水平与对数转换的右室收缩压以及肺均匀液中的炎症因子(IL6和TNF-α)具有很强的相关性。我们的研究结果为ACKR4可能作为一种以往未被认识的免疫保护检查点参与了PAH的病理性血管重塑提供了证据。
参考文献:
Jiang CY, Wu LW, Liu YW, Feng B, Ye LC, Huang X, He YY, Shen Y, Zhu YF, Zhou XL, Jiang DJ, Qi HK, Zhang H, Yan Y. Identification of ACKR4 as an immune checkpoint in pulmonary arterial hypertension. Front Immunol. 2023 Jun 28;14:1153573. doi: 10.3389/fimmu.2023.1153573. PMID: 37449198; PMCID: PMC10337759.
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