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冠状病毒因其广泛的宿主适应性以及跨种感染能力,在全球公共卫生领域一直是备受瞩目的焦点。以往人们认为冠状病毒属于不分节段的单股RNA病毒。上海交通大学沈永义和丁铲教授团队和广州国家实验室石正丽研究员团队联合中科院武汉病毒所曾磊平研究员团队、广州动物园陈武正高级兽医师团队等学者,在野生动物与驯养动物携带病毒监测中,从广东的小熊猫体内鉴定出一种新型的分节段冠状病毒,命名为LpCoV(Lesser panda coronavirus,小熊猫冠状病毒)。该研究鉴定了LpCoV具有独特的双节段基因组结构,即一个片段编码ORF1ab多聚蛋白,另一个片段编码表面刺突蛋白(S蛋白)和核衣壳蛋白(N蛋白),缺少包膜基因(E)和膜基因(M)。这是首个被确认的具有独特双节段基因组结构的冠状病毒,打破了人们对传统冠状病毒基因组不分节段的认知,扩展了冠状病毒的遗传谱,为冠状病毒的演化和起源提供了全新的视角。

图1:小熊猫冠状病毒LpCoV。(A)分成两个节段的基因组示意图。(B)系统发育关系。(C)病毒电镜照片。
在病毒学分类上,LpCoV与已知的α,β,γ,δ这4个冠状病毒属有极远的遗传距离(跟最近的冠状病毒相似性40%左右),而且基因组结构明显不同。依据国际病毒分类委员会(ICTV)的分类标准,该研究团队认为LpCoV是冠状病毒科内的一个新病毒属。为探明该病毒的分布,研究团队进一步展开了广泛的流行病学调查,来自中国四川省和江苏省的多个小熊猫群体中,发现5个与LpCoV相似的病毒序列。这一发现表明LpCoV在这一野生动物中的长期传播和扩散。这一发现还提示了需要加强对野生动物病毒的监测,评估病毒风险,减少这些病原对动物以及人类健康的威胁。
研究成果以 “Identification and genomic characterization of a novel bisegmented coronavirus in the lesser panda”为题目以预印本形式发表在biorxiv(https://www.biorxiv.org/content/10.1101/2024.11.26.625429v1)。
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