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FL的基因亚型
滤泡性淋巴瘤(FL)患者间在生物学特征和临床进程方面存在显著差异,但尚无权威的分类系统。为了解析FL的多样性,欧美多国学者利用基因组学、转录组学和甲基组学方法分析FL的异质性,将患者分为五种不同的基因亚型。结果近日发表于《Blood Cancer Journal》。
研究结果
学者基于多个研究队列中713例未经治疗的FL患者,使用治疗前肿瘤组织样本进行靶向DNA测序,共识别出57个基因,KMT2D(63.4%)和CREBBP(57.5%)是最常见的突变基因,其次是TNFRSF14(34.4%)、BCL2(32.7%)、EZH2(20.6%)、fox01(14.8%)和STAT6(13.1%)。
利用Bernoulli混合模型分为5种基因亚型,它们具有独特基因表达谱,且与临床病理特征相关。此外,这些clusters富集特定突变,具体如下:CS(CREBBP、TNFRSF14和STAT6)、TT(TNFAIP3、TP53和MYD88)、GM(GNA13和MEF2B)、Q(弱富集HLA-DMB和NOTCH1;静止型,低突变负荷)和AR(与mTOR通路相关的基因突变)。
亚型Q富集I期患者,与其他亚型相比具有较低的增殖史。AR亚型富集表达IgM的FL,与晚期和>4个淋巴结部位受累相关。
作者还在独立样本队列(GALLIUM试验中的418例样本)中验证了该亚型。
不同亚型的无进展生存期存在差异,尤其是TT亚型的患者在接受免疫化疗时始终表现出较差的无进展生存期。
总结
该研究揭示出FL中存在五种遗传亚型,显示出在基因突变、DNA甲基化特征和患者预后方面的差异,有助于更深入地了解FL的分子学和临床异质性,并可能指导亚型特异性治疗策略的发展,最终改善患者的预后。例如,可以推测mTOR抑制剂可能对AR亚型有效,而表观遗传学调节可能非常适合CS和GM亚型;TT亚型的患者可能从无化疗治疗策略中获益。未来的研究还需要评估靶向和其他新疗法对特定遗传背景的FL的获益。
参考文献
Shelton V, et al. Identification of genetic subtypes in follicular lymphoma.Blood Cancer J . 2024 Aug 7;14(1):128. doi: 10.1038/s41408-024-01111-w.
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