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目前,人们对种系遗传因素在决定皮肤黑色素瘤(CM)生存率方面的作用还不是很清楚。近日,发表于J Transl Med的一项研究进行了全基因组关联研究(GWAS)黑色素瘤特异性生存率(MSS)的荟萃分析,并检验CM易感性多基因风险评分(PRS)是否与MSS有关。
研究人员利用澳大利亚黑色素瘤研究所的数据对MSS进行了两次Cox比例危险分析,该研究所是一个高紫外线(UV)辐射环境(MIA;5762名黑色素瘤患者;800名黑色素瘤死亡)和英国生物银行(UKB:5220名黑色素瘤患者;241名黑色素瘤死亡),并在固定效应荟萃分析中结合起来。在利兹黑色素瘤队列(LMC;1,947名黑色素瘤患者;370名黑色素瘤死亡者)中调查了显著性结果(P < 5 × 10-8)。
此外,研究人员还利用一个大型独立的GWAS荟萃分析(23,913例,342,870例对照)开发了一个CM易感性PRS。在MIA和UKB队列中测试了PRS与MSS的关系。
结果显示,在MIA和UKB的荟萃分析中,有两个位点与MSS显著相关,即1号染色体上的rs41309643(G等位基因频率1.6%,HR=2.09,95%CI=1.61-2.71,P=2.08×10-8)和7号染色体上的rs75682113(C等位基因频率1.8%,HR=2.38,95%CI=1.77-3.21,P=1.07×10-8)。虽然这两个SNP都没有在LMC中复制,但rs75682113在合并的发现和复制组中是显著相关的。校正了诊断时的年龄、性别和前十个主成分后,CM易感性PRS增加一个标准差与MSS的改善有关(HR = 0.88,95% CI = 0.83-0.94,P = 6.93 × 10-5;I2 = 88%)。然而,这只是由高紫外线环境的队列驱动的(MIA HR = 0.84, 95% CI = 0.78-0.90)。
综上所述,该研究发现了两个可能与MSS相关的基因座。在高紫外线环境下,患CM的遗传易感性增加与MSS的改善有关。
原始出处:
Mathias Seviiri, et al., Higher polygenic risk for melanoma is associated with improved survival in a high ultraviolet radiation setting. J Transl Med. 2022 Sep 5;20(1):403. doi: 10.1186/s12967-022-03613-2.
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