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在过去的10年里,能够测量血液和体液中低丰度DNA的技术进步改变了分子诊断。无细胞DNA(cfDNA)被定义为源自任何细胞类型的细胞外DNA分子。循环肿瘤DNA(ctDNA)是指通过凋亡、坏死、红细胞切除和可能的活性分泌等各种机制释放在体液中的cfDNA的肿瘤衍生部分。
大多数关于ctDNA在肿瘤学中的应用的出版物都集中在血浆源性ctDNA。ctDNA分析被开发为评估体细胞分子改变的非侵入性、具有成本效益的替代品,特别是当肿瘤位置不利于活检时,如胰腺癌,当活检产量不足以进行诊断测试时,当需要反复评估肿瘤分子异常以优化治疗时,或当必须克服肿瘤异质性带来的理论限制时。
许多研究人员报告了使用ctDNA分析来指导特定肿瘤患者和不同肿瘤类型患者选择靶向疗法的临床试验结果。到目前为止,血浆ctDNA检测主要研究于转移性癌症。然而,还调查了其他应用,包括早期癌症诊断、确定原发性肿瘤组织、确定预后、评估治疗反应、确定抗药性机制、跟踪克隆进化以及在通过标准诊断方式(如成像等)看到疾病表现之前检测复发。
该领域的一个主要局限性是ctDNA分析尚未在肿瘤类型之间得到系统验证。ctDNA分析首次确立了选择EGFR改变的晚期非小细胞肺癌(NSCLC)患者和KRAS改变的结直肠癌患者的治疗方法。2019年,ctDNA分析还建立了肺癌ALK抑制剂耐药性管理。
2020年,美国食品和药物管理局(FDA)批准使用下一代测序(NGS)作为配套诊断技术,用于分析NSCLC中通过血浆ctDNA分析检测到的多种生物标志物;以及ALK重组治疗阿莱克替尼布、前列腺癌、卵巢癌和乳腺癌。
使用不同大小的面板和基因组分析,以及各种分析化学,可能导致肿瘤活检与ctDNA中发现的分子改变之间的差异,即使同时获得样本。采样时用于测试的方法、肿瘤异质性和肿瘤负担也可能有助于这些结果之间的差异。
虽然ctDNA检测点突变和小插入和缺失一直是大多数出版物的重点,但可以评估广泛的基因组改变,包括拷贝数变异、结构变异、甲基化、基因表达和突变特征,如肿瘤突变负担和微卫星不稳定性。为了优化ctDNA检测作为常规临床护理的一部分,应建立具有分析有效性、临床有效性和临床实用性既定标准的标准实践建议。
为了帮助解决这些问题,2023年10月6日发表在JOURNAL OF MOLECULAR DIAGNOSTICS对文章,描述了分子病理学协会(AMP)召集了一个多学科主题专家工作组,其中包括美国学会的组织代表临床肿瘤学和美国病理学家学院。
分子病理学临床实践委员会协会的液体活检工作组(LBxWG),包括美国临床肿瘤学会和美国病理学家学院的组织代表,对1228份ctDNA出版物进行了全文数据提取,这些出版物描述了在淋巴瘤和实体肿瘤恶性肿瘤患者中进行的分析。
研究结果显示,LBxWG强调临床检测验证,为验证、报告和发布临床ctDNA检测制定了一套13个最佳实践共识建议。建议包括报告关键的分析前考虑因素和检测性能指标;该分析表明,这些元素在出版物中不一致。LBxWG的建议旨在帮助临床实验室验证和报告ctDNA检测,并确保高质量的数据包含在出版物中。
报告关键预分析和分析参数的总和临床验证出版物的百分比
综上所述,在过去的十年里,血浆ctDNA检测越来越多地用于癌症诊断、治疗选择和治疗反应监测的临床实践。随着技术变得更加敏感,并且可以使用额外的试验来评估临床效用,因此发布分析前和检测性能特征至关重要。
仍然存在显著的知识差距,排除了临床环境中对ctDNA检测的广泛评估,例如筛查无症状个体和在治疗评估的早期调整护理。这种大型全文数据提取总结了围绕临床ctDNA检测的当前知识库,13条LBxWG建议旨在促进标准化,并就如何确保患者护理中高质量的临床ctDNA检测提供指导。
原始出处
Li, M. M., Datto, M., Duncavage, E. J., Kulkarni, S., Lindeman, N. I., Roy, S., ... & Nikiforova, M. N. (2017). Standards and guidelines for the interpretation and reporting of sequence variants in cancer: a joint consensus recommendation of the Association for Molecular Pathology, American Society of Clinical Oncology, and College of American Pathologists. The Journal of molecular diagnostics, 19(1), 4-23.
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