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肺动脉高压(PAH)是由各种原因引起的肺血管结构或功能改变,导致肺血管阻力和肺动脉压力增加,最终导致右心衰竭甚至死亡的一种临床综合征。在世界范围内,PAH的发病率高达每百万成人7.6例,发病率为每百万成人26至100例。特发性肺动脉高压(IPAH)是一种具有复杂病因的疾病。目前,IPAH的治疗是有限的,患者的预后也很差。
在肿瘤学领域,利用微阵列和高通量测序技术来预测疾病的潜在靶点已经非常成熟。近年来,这种方法也被用于检测PAH患者、动物或细胞样本,分析和筛选相应的基因治疗靶点。Gene Expression Omnibus(GEO)数据库提供了多组IPAH组织或细胞的基因表达微阵列数据。利用生物信息学分析方法可以帮助我们筛选与IPAH发病机制相关的潜在基因,为靶向治疗提供一定的指导。Bai Z等人通过使用加权基因共表达网络分析(WGCNA)算法,发现了与PAH相关的两个中心基因ECM2和GLT8D2。Lin W等人通过Robust Rank Aggregation(RRA)方法和实验发现TXNRD1作为IPAH的新型生物标志物和潜在治疗靶点。但是,目前的一些研究存在着只做理论预测,而没有通过实验进一步验证其预测结果的可靠性的缺点。
本研究旨在通过生物信息学探索IPAH的新治疗目标。从Gene Expression Omnibus(GEO)数据库中获得了符合要求的两个数据集(GSE113439和GSE130391)。然后,通过NetworkAnalyst平台对差异表达基因(DEGs)进行鉴定和分析。通过GO和京都基因和基因组百科全书(KEGG),我们检查了DEGs的功能。
利用CytoNCA插件构建了一个蛋白质-蛋白质相互作用(PPI)网络以确定中心基因。最后,筛选出四个中心基因:ASPM、CENPE、NCAPG和TOP2A。我们选择NCAPG进行蛋白水平的验证。我们建立了PAH的动物模型,发现NCAPG在PAH大鼠的肺部组织中表达明显增加。体外实验显示,NCAPG在增生的肺动脉平滑肌细胞(PASMCs)中的表达明显增加。当PASMCs的NCAPG被敲除后,细胞增殖受到抑制,这表明NCAPG与PASMCs的增殖有关。因此,这些结果可能为IPAH提供新的治疗目标。
参考文献:
Fu B, Li Y, Shi X, Liu P, Zhang Y, Tian H. NCAPG Promotes Pulmonary Artery Smooth Muscle Cell Proliferation as a Promising Therapeutic Target of Idiopathic Pulmonary Hypertension: Bioinformatics Analysis and Experiment Verification. Int J Mol Sci. 2022 Oct 4;23(19):11762. doi: 10.3390/ijms231911762. PMID: 36233060.
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